Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
COG7P83436 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COG7P83436 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COG7P83436 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COG7P83436 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COG7P83436 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COG7P83436 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COG7P83436 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COG7P83436 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COG7P83436 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COG7P83436 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COG7P83436 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COG7P83436 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COG7P83436 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms