Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms