Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms