Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms