Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms