Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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