Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms