Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms