Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms