Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms