Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA3P35244 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA3P35244 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms