Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCKBRP32239 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCKBRP32239 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCKBRP32239 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCKBRP32239 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCKBRP32239 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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