Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GCAP28676 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
GCAP28676 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms