Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO2P25791 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO2P25791 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO2P25791 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO2P25791 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms