Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms