Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms