Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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PTPREP23469 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPREP23469 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPREP23469 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPREP23469 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPREP23469 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PTPREP23469 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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