Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms