Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COL9A1P20849 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms