Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VCLP18206 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms