Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF4P18085 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF4P18085 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF4P18085 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF4P18085 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms