Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XBP1P17861 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms