Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DESP17661 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms