Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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