Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2BP0DI82 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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