Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms