Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms