Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms