Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP2O75323 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms