Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms