Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3O43889 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms