Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO3O43524 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms