Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms