Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms