Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms