Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms