Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms