Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms