Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP69A5D8W1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms