Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TRAF6Q9Y4K3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TRAF6Q9Y4K3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TRAF6Q9Y4K3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TRAF6Q9Y4K3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TRAF6Q9Y4K3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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