Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms