Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms