Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM50BQ9Y247 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms