Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms