Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms