Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms