Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APEX2Q9UBZ4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APEX2Q9UBZ4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APEX2Q9UBZ4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APEX2Q9UBZ4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APEX2Q9UBZ4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms