Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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COPS7AQ9UBW8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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