Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms