Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms